MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011989	GCC	2	6	307802	307807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147288
6002	NC_011989	GCCAGC	2	12	307863	307874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222147288
6003	NC_011989	GCCG	2	8	307906	307913	0 %	0 %	50 %	50 %	222147288
6004	NC_011989	CACG	2	8	308023	308030	25 %	0 %	25 %	50 %	222147288
6005	NC_011989	TGG	2	6	308064	308069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147288
6006	NC_011989	CGC	2	6	308103	308108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147288
6007	NC_011989	GCCT	2	8	308125	308132	0 %	25 %	25 %	50 %	222147288
6008	NC_011989	GCC	2	6	308184	308189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147288
6009	NC_011989	GGA	2	6	308281	308286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147288
6010	NC_011989	GAA	2	6	308342	308347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147288
6011	NC_011989	CTT	2	6	308467	308472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147288
6012	NC_011989	GCC	3	9	308484	308492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147288
6013	NC_011989	CAT	2	6	308692	308697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_011989	TTTG	2	8	308723	308730	0 %	75 %	25 %	0 %	222147289
6015	NC_011989	GCC	2	6	308745	308750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147289
6016	NC_011989	TGG	2	6	308791	308796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147289
6017	NC_011989	CAAT	2	8	308833	308840	50 %	25 %	0 %	25 %	222147289
6018	NC_011989	GGATT	2	10	308843	308852	20 %	40 %	40 %	0 %	222147289
6019	NC_011989	TCAC	2	8	308885	308892	25 %	25 %	0 %	50 %	222147289
6020	NC_011989	TGA	2	6	308900	308905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147289
6021	NC_011989	CCG	2	6	308935	308940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147289
6022	NC_011989	GTG	2	6	308976	308981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147289
6023	NC_011989	AGG	2	6	308986	308991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147289
6024	NC_011989	GCGGA	2	10	309173	309182	20 %	0 %	60 %	20 %	222147289
6025	NC_011989	CG	3	6	309186	309191	0 %	0 %	50 %	50 %	222147289
6026	NC_011989	CGC	2	6	309243	309248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_011989	TCC	2	6	309260	309265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_011989	TCC	2	6	309329	309334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147290
6029	NC_011989	AT	3	6	309339	309344	50 %	50 %	0 %	0 %	222147290
6030	NC_011989	CCA	2	6	309528	309533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147290
6031	NC_011989	TGC	3	9	309543	309551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147290
6032	NC_011989	CCG	2	6	309560	309565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147290
6033	NC_011989	GTC	2	6	309626	309631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147290
6034	NC_011989	GCC	2	6	309697	309702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147290
6035	NC_011989	CGG	2	6	309723	309728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147290
6036	NC_011989	ATC	2	6	309761	309766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147290
6037	NC_011989	TCCAC	2	10	309804	309813	20 %	20 %	0 %	60 %	222147290
6038	NC_011989	CGA	2	6	309817	309822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147290
6039	NC_011989	CTGC	2	8	309893	309900	0 %	25 %	25 %	50 %	222147290
6040	NC_011989	TGG	2	6	309930	309935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147290
6041	NC_011989	TGCC	2	8	309966	309973	0 %	25 %	25 %	50 %	222147290
6042	NC_011989	ATG	2	6	309978	309983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147290
6043	NC_011989	CATG	2	8	309994	310001	25 %	25 %	25 %	25 %	222147290
6044	NC_011989	TGG	2	6	310003	310008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147290
6045	NC_011989	GAC	2	6	310030	310035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147290
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6047	NC_011989	CTG	2	6	310091	310096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147290
6048	NC_011989	GAA	2	6	310168	310173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147290
6049	NC_011989	CGG	2	6	310177	310182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147290
6050	NC_011989	CAGA	2	8	310317	310324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_011989	CTT	2	6	310331	310336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_011989	GTC	2	6	310502	310507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_011989	TAA	2	6	310584	310589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_011989	TCG	2	6	310780	310785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147291
6055	NC_011989	GGC	2	6	310829	310834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147291
6056	NC_011989	GCC	2	6	310859	310864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147291
6057	NC_011989	CGG	2	6	310891	310896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147291
6058	NC_011989	AAGG	2	8	310905	310912	50 %	0 %	50 %	0 %	222147291
6059	NC_011989	GGC	2	6	310949	310954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147291
6060	NC_011989	CCG	2	6	310969	310974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147291
6061	NC_011989	GCC	2	6	311028	311033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147291
6062	NC_011989	CGG	2	6	311050	311055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147291
6063	NC_011989	CGG	2	6	311095	311100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147291
6064	NC_011989	GGC	2	6	311114	311119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147291
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6066	NC_011989	CCTG	2	8	311240	311247	0 %	25 %	25 %	50 %	222147291
6067	NC_011989	GCT	2	6	311298	311303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147291
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6070	NC_011989	GAT	2	6	311420	311425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147291
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6073	NC_011989	GGC	2	6	311507	311512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147291
6074	NC_011989	GGC	2	6	311520	311525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147291
6075	NC_011989	GC	3	6	311531	311536	0 %	0 %	50 %	50 %	222147291
6076	NC_011989	CCGG	2	8	311537	311544	0 %	0 %	50 %	50 %	222147291
6077	NC_011989	GT	3	6	311569	311574	0 %	50 %	50 %	0 %	222147291
6078	NC_011989	CGC	2	6	311602	311607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147291
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6080	NC_011989	GGCG	2	8	311735	311742	0 %	0 %	75 %	25 %	222147291
6081	NC_011989	GCT	2	6	311810	311815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147291
6082	NC_011989	CCG	2	6	311845	311850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147291
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6084	NC_011989	CGCC	2	8	311903	311910	0 %	0 %	25 %	75 %	222147291
6085	NC_011989	GGCG	2	8	311954	311961	0 %	0 %	75 %	25 %	222147291
6086	NC_011989	TGC	2	6	312026	312031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147291
6087	NC_011989	GCG	2	6	312054	312059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147291
6088	NC_011989	ATC	2	6	312088	312093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147291
6089	NC_011989	CTG	3	9	312232	312240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_011989	CTG	2	6	312252	312257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_011989	AAC	2	6	312328	312333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_011989	CAA	2	6	312351	312356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_011989	CAA	2	6	312409	312414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_011989	ATT	2	6	312498	312503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147292
6095	NC_011989	GA	3	6	312530	312535	50 %	0 %	50 %	0 %	222147292
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6099	NC_011989	GGC	2	6	312622	312627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147292
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6102	NC_011989	GCCGGT	2	12	312871	312882	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222147292
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6105	NC_011989	GGT	2	6	312958	312963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147292
6106	NC_011989	CTG	2	6	313000	313005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147292
6107	NC_011989	GAT	2	6	313009	313014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147292
6108	NC_011989	GCA	2	6	313178	313183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147292
6109	NC_011989	ATC	2	6	313280	313285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147292
6110	NC_011989	GAA	2	6	313324	313329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147292
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6112	NC_011989	CGGCCA	2	12	313436	313447	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222147292
6113	NC_011989	CTT	2	6	313450	313455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147292
6114	NC_011989	TG	3	6	313467	313472	0 %	50 %	50 %	0 %	222147292
6115	NC_011989	TCC	2	6	313474	313479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_011989	A	6	6	313563	313568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_011989	CGC	2	6	313606	313611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147293
6118	NC_011989	GGC	2	6	313627	313632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147293
6119	NC_011989	GGC	3	9	313651	313659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147293
6120	NC_011989	GCT	2	6	313686	313691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147293
6121	NC_011989	CAG	3	9	313693	313701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147293
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6123	NC_011989	CCG	2	6	313785	313790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147293
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6246	NC_011989	GCCC	2	8	320069	320076	0 %	0 %	25 %	75 %	222147299
6247	NC_011989	GGC	2	6	320116	320121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147299
6248	NC_011989	GAA	2	6	320232	320237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147299
6249	NC_011989	CAG	2	6	320245	320250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147299
6250	NC_011989	GCT	2	6	320252	320257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147299
6251	NC_011989	GTTCG	2	10	320268	320277	0 %	40 %	40 %	20 %	222147299
6252	NC_011989	ACG	2	6	320356	320361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_011989	GCA	2	6	320405	320410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6254	NC_011989	CCGC	2	8	320460	320467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6255	NC_011989	CGA	2	6	320515	320520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6257	NC_011989	ATGGC	2	10	320659	320668	20 %	20 %	40 %	20 %	222147300
6258	NC_011989	TCG	2	6	320737	320742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147300
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6263	NC_011989	TTG	2	6	321054	321059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147300
6264	NC_011989	CTG	2	6	321123	321128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147300
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6274	NC_011989	GTTG	2	8	321493	321500	0 %	50 %	50 %	0 %	222147301
6275	NC_011989	GTC	2	6	321549	321554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147301
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6284	NC_011989	CGG	2	6	322371	322376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147302
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6289	NC_011989	ATC	2	6	322620	322625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6313	NC_011989	GAG	2	6	323879	323884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147304
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6330	NC_011989	GCC	2	6	324807	324812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147305
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6347	NC_011989	CTG	2	6	325612	325617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147305
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6349	NC_011989	AT	3	6	325754	325759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6350	NC_011989	GCG	2	6	325777	325782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6351	NC_011989	GCC	2	6	325869	325874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147306
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6354	NC_011989	GCG	2	6	325959	325964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147306
6355	NC_011989	GAT	2	6	325965	325970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147306
6356	NC_011989	GGA	2	6	325974	325979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147306
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6358	NC_011989	GGTTG	2	10	326070	326079	0 %	40 %	60 %	0 %	222147306
6359	NC_011989	GCC	3	9	326107	326115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147306
6360	NC_011989	GGC	2	6	326217	326222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147306
6361	NC_011989	TGC	2	6	326223	326228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147306
6362	NC_011989	CTG	2	6	326236	326241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147306
6363	NC_011989	TCG	2	6	326300	326305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147306
6364	NC_011989	CATTGC	2	12	326316	326327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222147306
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6487	NC_011989	CGA	2	6	331909	331914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147312
6488	NC_011989	GAA	2	6	331943	331948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147312
6489	NC_011989	AGGA	2	8	331971	331978	50 %	0 %	50 %	0 %	222147312
6490	NC_011989	CGG	2	6	332017	332022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147312
6491	NC_011989	TCCAT	2	10	332062	332071	20 %	40 %	0 %	40 %	222147312
6492	NC_011989	TGA	2	6	332074	332079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147312
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